北京联科中医肾病医院目前设有内科:呼吸内科专业:消化内科专业;神经内科专业;心血管内科专业:肾病学专业;内分泌专业:免疫学专业; 老年病专业/外科:普通外科专业;骨科专业;泌尿外科专业/儿科:小儿肾病专业/眼科/皮肤病专业/肿瘤科/康复医学科/麻醉科/医学检验科;临床体液、血液专业;临床微生物学专业;临床化学检验专业;临床免疫、血清学专业/病理科/医学影像科;X线诊断专业;超声诊断专业;心电诊断专业/中医科:内科专业;外科专业:妇产科专业;儿科专业;皮肤科专业;限科专业:肿瘤科专业:骨伤科专业;肛肠科专业;老年病科专业;针灸科专业;推拿科专业;康复医学专业/中西医结合科，开展相关医疗业务。并且在所开展的科室业务上具有较为稳定的临床特色和科研方向。

        近年来，该院所有的科室前瞻性的预见到肾病科、内分泌科、心血管科、外科、儿科、眼科等疾病学科的防治将成为临床要点，在早期开展并建立了相应的流行病学和规范化随访队伍，并对CKD、内分泌科、心血管科、外科、儿科、眼科等疾病患者进行科学管理，大大提高了患者的生存时间及生存质量。
       
        多年来，北京联科中医肾病医院的肾病科、内分泌科、心血管科、外科、儿科、眼科均依托跨学科研究及学术交流，相信在各个科室医护人员的齐心努力下，北京联科中医肾病医院的明天将更加灿烂辉煌。